Gminę także należy skontrolować
Naczelne organy władzy publicznej, sądy i trybunały mają obowiązek przeprowadzania kontroli wewnętrznej. Muszą ją także przeprowadzać wszystkie podmioty należące do sektora finansów publicznych, które gromadzą środki publiczne lub dokonują znacznych wydatków.
Do tej kategorii zaliczają się również jednostki samorządu terytorialnego. Szczegółowe określenie kwot, po których przekroczeniu powstaje obowiązek stosowania audytu wewnętrznego, należy do ministra finansów. Obecnie kwota ta wynosi 40 mln zł.
Audytor powinien być niezależny, dlatego podlega bezpośrednio i wyłącznie kierownikowi jednostki. Ma to wzmocnić jego obiektywizm i rzetelność przeprowadzanych czynności. Również jego stosunek pracy podlega szczególniej ochronie. Zwolnienie pracownika zatrudnionego na tym stanowisku jest możliwe jedynie za zgodą ministra finansów. Zasady i tryb przeprowadzania audytu określa ustawa z 30 czerwca 2005 r. o finansach publicznych.